明保宁府左参将：罗于萃，在中途拦截斩杀了部分流寇，在穷追流寇于汉中府西乡县子午谷巡检司一带，夺其所掠子女二千口，使贼奔赴汉中府石泉县饶风关巡检司。

同时逃入南直隶凤阳行都督府的流寇们，继续攻陷了庐州府巢县、和州含山县。

明崇祯九年公元1636年正月13日，明四司总督兼湖广总镇巡抚：卢象升，会师南直隶明军于凤阳行都督府，在勒令各路兵马进剿。

很快农民军：闯王（高迎祥）、闯塌天（刘国能）、西营八大王（张献忠）、摇天动，等部流寇连营数十万军队，便一起合力攻打南直隶滁州。

农民军们环山为营，包围了平原百余里。

明南直隶行太仆寺寺卿：李觉斯、明滁州知州：刘太巩，督率军民上城楼固守，流寇则架云梯冲锋，又挖战壕在城外抵挡明军炮火轰炸。

还修了百道环形战壕进攻，城头火轮巨炮相续发射，山下多数地方被炸成烂泥。

明军们以滚油、万人敌、弓箭、火铳，抗击爬上云梯的流寇，致使流寇们的进攻减弱，开始撤兵。

流寇们夜间又再次进攻，开挖了支河想引河水入城内，在骑着黑牛、战马渡河攻城，但城上明军连炮轰炸，让流寇们死伤惨重不得不再次撤退。

就在流寇们撤退之时，还趁机劫掠了隐居落山谷的妇女数百人，皆去衣裳裸而淫之！尽断其头为乐，孕者则被开膛刨腹，手段极其残忍。

滁州卫明军们出动观望之际，大多都是掩面不忍直视，明将们也不敢出击，只是开炮轰炸城外流寇罢了！

寅时，明四司总督兼兵部尚书：卢象升，和诸道援军赶来驰援南直隶滁州与滁州卫，以明宁远卫指挥使：祖大乐、明宁远卫左参将：祖宽，为前锋。

率领宁远卫明军与辽东铁骑冲杀过来，在以火攻三营（火铳、火炮、战车营）为后劲，由明四司总督亲率麾下三百铁骑居中督战。

因部分流寇们还在抢劫当中，所以没有布置防御，故此明军杀来之际，多数流寇被屠杀。

其中明宁远卫左参将一马当先，冲到阵前，被流寇们群起接战，后方明将们则战于城东五里桥，官军们踊跃争奋以各类手雷如；风火震天雷、霹雳伏火雷、土雷、陶雷，等炸向流寇。

各路明军又追逐流寇北退五十里地，积尸遍野，缴获器械众多，斩首一千二百人。

其中明淮安府总督兼山东总镇巡抚：朱大典，还派明淮安府左参将：杨世恩，复截流寇于凤阳行都督府定远县，又斩首了六百人。

流寇余部一路东奔定远县，藏于嘉山之中。

而明宿松总兵：刘良佐，则扼守凤阳行都督府西北方向的英武卫，让流寇们继续向西突破池河守御百户所。

待过了池河守御百户所之后，流寇们再出滁州卫东冈守御百户所，明东岗守御百户：刘光辉，为了打击流寇，亲率五百人死守东冈守御百户所。

但流寇数万大军到来围城时，守御百户所内的明军们很快就弹尽粮绝了！

明东岗守御百户还被射中三箭，摔落下去护城河中，其余明军皆战死，被流寇进城夺其盔甲与（玄鸟）旗帜渡河。

企图冒充明军，继续往南进入南直隶应天府江浦县地区。

因为是快速通行的，又不用出示令牌、路引以及汇报上司，故此有士兵就上报明中军都督府右都督兼应天府提督总兵：杜弘域，他感觉不对劲？

于是连忙从江浦县渡河追去。

而滁州溃败的流寇们，则再次西向凤阳行都督府进犯中都留守司皇陵卫，使得明淮安府总督兼山东总镇巡抚：朱大典、明凤阳行都督府总兵：杨御蕃，急忙列营保护皇陵卫城墙。

明军们把守甚严不许进出，让流寇们不敢轻易进攻，便西渡河劫掠凤阳行都督府怀远县。

另外湖广承宣布政使司襄阳府枣阳县，有山贼大当家：廖三、二当家：袁世儒、三当家：李玉石，以牛羊好酒迎中原流寇：张乐、高燕，合伙入营一同抢劫。

正月21日，南直隶流寇：紫薇星，率部攻陷了凤阳行都督府怀远县，但马上就被明淮安府总督率兵前来围剿。

流寇们连忙放火北逃，还继续攻陷了凤阳行都督府灵璧县、进逼泗州。